מוקדם יותר היום, עצר חיל הים ספינה לבנונית שיצאה מטריפולי לכיוון עזה. הספינה, לפי הדיווחים, הייתה עמוסה במזון ובציוד הומניטרי. הערב הסתיימה פריקת הציוד מהספינה, וככל הנראה לא נמצא עליה נשק.
שעות לאחר האירוע, מפרסם דובר צה"ל תמונות שצולמו מתוך ספינת חיל הים, ובהן נראית אותה ספינה לבנונית. בסרטון נראים הנוסעים, אנשי ארגוני סיוע ואנשי תקשורת זרים, על הסיפון. דקות לאחר צילום אותן תמונות, השתלט חיל הים על הספינה והוביל אותה לנמל אשדוד.
כתבת אל ג'זירה, סלאם חודר, שהייתה על הספינה, דיווחה כי "אנשי האוניה סרבו להישמע להוראות חיל הים הישראלי - שהורה להם לשוב על עקבותיהם ללבנון. שלושה צוללנים הגיחו מתחת לאניה והשתלטו עליה. לאחר מכן איימו בנשקם על אנשי הצוות שלה".
