בשעות הצהריים (שלישי) הודיע צה"ל כי מטוסי קרב של חיל האוויר תקפו זמן קצר קודם לכן, באופן ממוקד ובהכוונה מודיעינית של אמ"ן, השב"כ ואוגדה 252, מחבלים שפעלו במתחמי פיקוד ושליטה של ארגון הטרור חמאס, שהוקמו במבנה ששימש בעבר כמסגד "אלפארוק" ובסמוך לו במרחב אל-בוריג'.
מתחם הפיקוד והשליטה שימש את מחבלי החמאס לתכנון והוצאה לפועל של פעולות טרור נגד כוחות צה"ל ומדינת ישראל. טרם התקיפה ננקטו צעדים רבים בכדי לצמצם את הסיכוי לפגיעה באזרחים, שבהם משתמשים ארגוני הטרור כ"מגן אנושי".
קודם לכן עדכן צה"ל באשר לתקיפה שביצע הלילה (בין שני לשלישי) על מתחם פיקוד ושליטה אחר של מחבלי ארגון הטרור חמאס, שהוסווה במרחב ההומניטרי בח'אן יונס שברצועת עזה. דובר צה"ל הודיע על זהותם של כמה מהמחוסלים הבולטים באותה תקיפה. "מחבלים אלו היו מעורבים באופן ישיר בטבח 7 באוקטובר, ופעלו להוצאת מתקפות טרור נגד כוחות צה"ל ומדינת ישראל במהלך התקופה האחרונה", נמסר מצה"ל.
ביניהם הותקף המחבל סאמר אסמעיל חדר אבו-דקה, ראש מערך האווירי של ארגון הטרור חמאס ברצועת עזה. כמו כן, הותקפו המחבלים אסאמה טבש, ראש מחלקת התצפיות והמטרות במטה המודיעין הצבאי של ארגון הטרור חמאס, והמחבל אימן מבחוח, בכיר נוסף בארגון הטרור חמאס.
בצה"ל מדגישים כי "ככלל, ועל פי בדיקה ראשונית המספרים שמפרסם משרד ההסברה העזתי של ארגון הטרור חמאס שנתפס משקר מספר פעמים, לא עולים בקנה אחד עם המידע הקיים בצה"ל, החימושים המדויקים בהם נעשה שימוש והדיוק בפגיעה".
עוד הוסיפו בצה"ל בהודעתם בנושא כי "למרות האמצעים הרבים שצה"ל נוקט על מנת לאפשר לתושבי עזה להתרחק מאזורי קרב, ובהם הגדרת האזור ההומניטרי, ארגון הטרור החמאס ממשיך להטמיע את הפעילים והתשתיות הצבאיות שלו באזור ההומניטרי, ולהשתמש באזרחים כמגן אנושי באופן שיטתי".
כמו בכל התקיפות מהסוג הזה, הדגישו בצה"ל עוד בהודעתם הראשונית כי טרם התקיפה בוצע איסוף מודיעין ממושך, וכן תצפית אווירית רצופה בשעות שקדמו לתקיפה באופן שאימת את הימצאותם במרחב לצד מחבלים נוספים.
את התקיפה ביצעו מטוסי קרב של חיל האוויר בהכוונת השב"כ, אמ"ן ופיקוד הדרום. היא כוונה אל מי שהוגדרו כ"מחבלים מרכזיים" של ארגון הטרור חמאס, שפעלו באותו מתחם פיקוד ושליטה שהוסווה במרחב ההומניטרי בח'אן יונס.
"זוהי דוגמה נוספת לשימוש השיטתי של ארגוני הטרור ברצועה באוכלוסייה ובתשתיות אזרחיות, בהן המרחב ההומניטרי, לצורך ביצוע פעולות טרור נגד מדינת ישראל וכוחות צה"ל", מסרו בצבא בהודעתם המקורית על התקיפה.
בצה"ל הדגישו מראש כי טרם התקיפה ננקטו צעדים רבים כדי לצמצם את הסיכוי לפגיעה באזרחים, לרבות שימוש בחימוש מדויק, חוזי מהאוויר ומידע מודיעיני נוסף.