פעילי הזרוע הצבאית של החמאס (עז-אדין אל קאסם) ושל ועדות ההתנגדות העממית (גדודי סאלח א-דין) שנהגו לעבור הכשרה צבאית ממושכת במחנות האימונים בסוריה ובאירן עברו להתאמן בסודן ובתימן.
בשבועות האחרונים הולכות וגוברות העדויות לשיתוף הפעולה בין סודן לאירן והחמאס. לפני מספר שבועות הופצץ באישון לילה בסיס הנשק "ירמוכ" שבחרטום בירת סודן. הסודנים מיהרו להאשים את ישראל וטענו שהיא היחידה בעלת יכולות להפצצה מהסוג הזה. כמה ימים לאחר מכן תועדה כניסתן של שתי ספינות אירניות לנמל פורט סודן, כששני הצדדים מכחישים שיתוף פעולה בינהן. כמה ימים מאוחר יותר צוטט נשיא סודן כאומר: "נמשיך לתמוך בחמאס, התוקפנות הישראלית לא מרתיעה אותנו".
ארגון ועדות ההתנגדות העממית נחשב לארגון המסוכן ביותר הפועל ברצועת עזה. ראש הזרוע לשעבר, ג'מאל אבו סמהדנא, היה זה שהגה את חטיפת גלעד שליט וזמן קצר לפני מבצע החטיפה חוסל על ידי כלי טייס של חיל האויר. בשנה האחרונה חוסלה כל צמרת האירגון אשר בכיריו היו מעורבים בפיגוע הקטלני בכביש 12 המוביל לאילת. פיגוע בו נהרגו שבעה אזרחים ונפצעו עוד 29. בין השאר חוסלו עימאד חאמד, מחליפו של אבו סמהדנא, זוהיר אלקייסי, כמאל נירב וחאלד אל מצרי, כולם מבוקשים בכירים.
פעילי האירגון עברו הכשרות ממושכות שנמשכות כשנה במחנות אימונים באיראן ובסוריה. ההכשרות כללו שיגור טילי כתף מתקדמים מסוג 'סטרלה' לעבר מטוסים ומסוקים, הפעלת טנקים ונגמ"שים, ירי פצמ"רים, גראדים ורקטות והוכשרו להיות חיילי קומנדו לכל דבר ועניין.
כך סיפר פעיל של ועדות ההתנגדות העממית שנעצר על ידי השב"כ וצה"ל לפני כארבע שנים: "נסענו למצרים ומשם טסנו לדמשק. באוטובוסים חשוכים נסענו למחנות אימונים בסוריה וכעבור כמה חודשים עברנו להתאמן במחנה אימונים באיראן, קרוב לטהרן. שם קציני קומנדו רוסיים ואירניים לימדו אותנו לוחמת גרילה".
בעקבות מלחמת האזרחים שפרצה בסוריה לפני כשנה וחצי נסגרו מחנות האימונים במדינה ובכירי שני הארגונים, החמאס ו-ועדות התנגדות, נאלצו למצוא אלטרנטיבות אחרות כדי להכשיר את פעיליהם. לאחרונה כמה עשרות פעילים של הזרועות הצבאיות עברו הכשרה בסודן ובתימן. חלק מהקורסים מועברים על ידי קצינים אירנים וההכשרה כוללת קורסי ירי של טילים ארוכי טווח חדשים ואמצעי לחימה חדשים שטרם נעשה בהם שימוש ושחלקם הגיעו באחרונה לרצועת עזה מלוב וסודאן.