הוריקן "סנדי" גרם על פי ההערכות לנזק של מיליארדי דולרים, אבל במדינת ניו יורק חוששים מאוד מהפגיעה החמורה במערכת הרכבות התחתית – הסאבווי. הוול סטריט ז'ורנל מדווח, כי כמויות המים האדירות ששילחה הסופה חסמו לפחות שש מנהרות של הרכבת התחתית וגרמו לנזק רציני שעלול לפגוע בחזרה מהירה לשגרה של הרכבת.
אחד הנזקים הגדולים שעלולה לגרום הסופה, היא שחיקה של רכיבי הרכבת בעקבות כניסת המים המלוחים הרבים. לדברי מנהלי חברת הרכבותMTA המלח עלול לגרום נזק בלתי הפיך למנועים, למתכות ולחלקים אלקטרונים ישנים. הדאגה הגדולה היא שחלקים ישנים, כבני מאה, שאין להם כבר תחליפים בנמצא, ייהרסו מהמים – מה שיגרום לעיכוב משמעותי בחזרה לשגרה. מנכ"ל MTA ג'וזף לוטה אמר במסיבת עיתונאים מיוחדת: מערכת הסאבווי שלנו ומי מלח לא מתערבבים טוב".
בהנהלת הרכבת מוסרים ששאיבת המים עשוייה לקחת בין 14 שעות לארבעה ימים ורק לאחריה יידעו להעריך את הנזק שנגרם. מערכת הרכבות משרתת 5.2 מיליון נוסעים ביום והכרחית לכלכלת העיר.