בתקופה האחרונה דובר על כך שדאע"ש מגייס לשורותיו רופאים זרים מרחבי העולם, ביניהם רופאים ישראלים. לאחרונה, התברר כי הדבר נעשה בין היתר במטרה לערוך ניתוחים ולאסוף איברים פנימיים של בני אדם, על מנת למכור אותם. "הסחורה" מגיעה בין היתר מגופותיהם של לוחמי ג'יהאד שנהרגו והובלו במהרה לבית החולים. מעבר לכך, איברים פנימיים נלקחים גם מבני ערובה חיים, בני קהילות שונות בסוריה ובעירק, ביניהם גם ילדים.
לאחר חשיפת שוק הנערות של דעא"ש, המידע המחריד בדבר שוק האיברים פורסם לראשונה באתר al-Monitor, שם צוטט רופא אף אוזן גרון בשם סילוואן אל-מוסולי. הוא סיפר כי כבר במשך תקופה שוכר ארגון הטרור רופאים זרים, שמתפעלים את שוק האיברים שהוקם בבית חולים בעיר מוסול. "יש מספר יוצא דופן של רופאים מנתחים זרים שהחלו לעבוד בבית החולים במוסול, שלא הורשו ליצור קשר עם רופאים מקומיים. לאחרונה דלף מידע לגבי סחר באיברים". בנוסף, ציין הרופא כי בית החולים כבר החל להפיק רווחים כספיים אדירים כתוצאה ממכירת איברים.
לשם הרצת העסק החדש, הקים ארגון הטרור יחידה מיוחדת שיעודה הוא הברחת האיברים. אחריותה הבלעדית היא למכור איברים כמו לב, כבד או כליה בשוק השחור. מרבית האיברים שנמכרים, מועברים על ידי מערכת משומנת היטב מעירק וסוריה, הישר למדינות כמו טורקיה וערב הסעודית. כנופיות העבריינים שממתינות למשלוחים, מקבלות את האיברים ומוכרות אותם לקונים חשוכים ברחבי העולם.
לא רק שוק האיברים מסייע לדאע"ש לגלגל מיליונים, אלא גם הטלת מיסים קשים על תושבי שטחי העימותים: מעבר להעלאת המס על מזון פי 4, כל משפחה מחויבת בתשלום "דמי שירות והגנה" – 50,000 דינרים (41.6 $), כשמשפחות שילדיהן לא התגייסו למאבק המדינה המוסלמית, מחויבות בתשלום מס כפול. משפחות בעלות יכולת שמעוניינות לברוח מהתופת ולהגר למדינות כמו טורקיה, נדרשות לשלם לדאע"ש 8,000 דולר עבור כל אדם.
אתר Al Monitor מדווח כי ארגון הטרור משתלט גם על שוק הסמים של אירופה, ומבריח כמות גדולה של הרואין תוצרת אפגניסטן. למעשה, על פי מידע שפרסם איגוד התרופות הפדרלי הרוסי, הברחת הסמים של הארגון משגשגת ושולטת כעת בחצי משוק ההרואין ברחבי אירופה.
למרות תחומיו העסקיים החדשים של ארגון הטרור, מכירת נפט גולמי עדיין מהווה את מקור ההכנסה העיקרי שלו, כשהיא מגלגלת מיליון דולר מידי יום.