על רקע חלוקת סמכויות הצבא בתוך משרד הביטחון, הרמטכ"ל ושר הביטחון לשעבר בני גנץ הזהיר היום (שני) שהדבר עלול להוביל להתפרקות של צה"ל. "שמעתי את דבריו של גלנט בנאום שלו שמבהיר בצורה צודקת אי אפשר לשחק עם אחדות הפיקוד", התייחס גנץ היום (שני) בשיחה עם חדשות 12 לנאום שר הביטחון בטקס חילופי הרמטכ"ל.
על פי הסיכומים הקואליציוניים, שר האוצר בצלאל סמוטריץ' אחראי בתוך משרד הביטחון על המנהל האזרחי – הגוף הצבאי שאחראי על השליטה האזרחית ביו"ש. "הדבר לא מתאים לחוליה בצה"ל ולא בצבא כולו", טען יו"ר המחנה הממלכתי. "אי אפשר שיהיו כמה ראשי פיקוד באירוע הזה. כל הנתחים שקיבלו יצטרכו להיות כפופים בצורה מוחלטת לשר הביטחון ולרה"מ - אחרת הצבא יתפרק".
בטקס כניסת הרצי הלוי לתפקיד הרמטכ"ל, שר הביטחון יואב גלנט העביר מסר לשר בצלאל סמוטריץ': "אוודא כי לחצים חיצוניים, פוליטיים, משפטיים ואחרים, נעצרים אצלי ולא מגיעים לשערי צה''ל. הרמטכ"ל כפוף לשר הביטחון ונתון למרות הממשלה".
הרמטכ"ל הנכנס הרצי הלוי גם כן העביר מסר דומה: "נכין את צה"ל למלחמה מול זירות רחוקות כקרובות, נרחיב את הגיוס האיכותי לצה"ל מכל שכבות האוכלוסייה – מקור כוחנו; נחזק את צבא המילואים ונשמור על צה"ל אחד, ענייני, ערכי ומקצועי, חף מכל שיקול שאיננו הביטחון".
הרמטכ"ל היוצא אביב כוכבי אמר מילות פרידה משירותו הצבאי הממושך והזכיר את החשיבות שיש באחדות בתוך צה"ל: "צבא העם, המגן על העם, שמגלם את הטוב שבעם. זהו טוב הנובע גם מהעובדה שצה"ל מאחד את העם. משרתים בצה"ל אנשים בעלי דעות ואמונות שונות אשר מוכיחים יום יום שלצד שונות אפשר לקיים אחדות וחברות. דווקא בימים אלו של קיטוב ומחלוקת, השירות הצבאי המשותף של כל גווני החברה, מזכיר לנו שאנו עם אחד, עם מטרה אחת ועם עתיד משותף אחד".