כוח פלנ"ט 646, לוחמי צנחנים במילואים, עצרו הלילה (בין שבת לראשון) במחנה הפליטים ג'נין את המחבל שרצח בחודש אוגוסט האחרון את שי ניגרקר ואביעד ניר, אב ובנו תושבי אשדוד, במכון לשטיפת רכבים בחווארה. בנוסף, הכוח איתר מטענים מוכנים להפעלה ואמצעי לחימה נוספים.
השניים, בני 60 ו-28, הגיעו לכפר בשעות הבוקר לסידורים, שטפו במכון את רכבם ונורו בזמן שהמתינו סמוך לו. מחבל חמוש זיהה שהם מדברים עברית, ירה בהם מטווח אפס ונמלט לאזור שכם - והמצוד אחריו נמשך חודשים.
בתיעוד הפיגוע נראים השניים כשהם עומדים סמוך לרכבם במכון שטיפת הרכב. המחבל תועד כשהוא מתקרב אליהם, נעמד מולם ויורה בהם מטווח קצר. לאחר מכן הוא ממשיך בריצה ונמלט מהמקום. השניים נפצעו אנוש מהירי הקטלני ובהמשך נקבע מותם בתום פעולות החייאה.
רינה סטמקר, בת זוגו של שי ב-20 השנה האחרונות, סיפרה ל-N12 לאחר מותו על הרגע שבו הבינה כי שי נפגע: "התקשרתי והוא לא ענה, אשתו לשעבר התקשרה אליי ואמרה שקרה משהו, פתאום דודה שלו התקשרה וצרחה שהיה פיגוע ושי מת".
סטמקר סיפרה כי בן זוגה יצא בשעות הבוקר המוקדמות עם בנו כדי לבצע תיקונים ברכב, והספיק לשוחח איתה זמן קצר לפני הפיגוע הרצחני: "הוא אמר שיסיים את העבודות ויחזור. הוא שלח לי תמונות מחברים שלו שם, הוא כל הזמן היה נוסע עם הילדים וגם אני הייתי איתו שם כמה פעמים. יש לו חברים שם - כולם בחווארה הכירו אותו".