שלושה חודשים לאחר אירוע הירי סמוך למסגד בכפר כנא, במהלכו נורה למוות נסים חמזה בזמן שישב ברכבו, תגיש פרקליטות מחוז צפון כתב אישום כנגד חמישה נאשמים, כולם תושבי כפר כנא, לבית המשפט המחוזי בנצרת.
כתב האישום הגיע בתום חקירה של היחידה ללוחמה בפשיעה של מרחב עמקים במחוז הצפוני, במהלכה נאספו מאות מצלמות ובוצעו פעולות חקירה רבות. כזכור, חמזה נורה בסוף מאי האחרון אז התקבל דיווח במוקד המשטרה אודות אירוע ירי לעבר רכב בכפר כנא במהלכו נפצע המנוח נסים חמזה ובהמשך נקבע מותו בבית החולים. כוחות משטרה רבים של המחוז הצפוני הגיעו לזירה והחלו במלאכת איסוף הראיות והממצאים.
בתום חקירה סמויה בת חודש וחצי במהלכה נאספה תשתית ראייתית, פשטו מסתערבי החטיבה הטקטית של משמר הגבול ביוני האחרון על דירת מסתור במרחב העיר גנין ועצרו שלושה אחים חשודים ברצח לאחר שברחו ונעלמו כבר ביום האירוע ועצרו שני מעורבים נוספים באירוע הרצח.
מחומר החקירה עולה כי בין המנוח לבין אביהם של שלושת האחים הנאשמים נוצר סכסוך עסקי על רקע פירוק שותפות עסקית בעקבותיו החליטו האחים לרצוח את המנוח. ביום הרצח הגיעו שלושת האחים (ששימשו כחוליית הביצוע) יחד שני הנאשמים נוספים שתפקידם היה לעקוב אחר הקורבן בשני רכבים שונים ולהעביר לחוליית החיסול את המידע בזמן אמת אודות מיקומו של הקורבן.
לאחר שזוהה הקורבן נכנס למסגד, התכוננה חוליית החיסול לביצוע הרצח, ארבה לו בקרבת מקום ומיד כאשר יצא מהמסגד ועלה לרכבו בוצע הרצח מטווח אפס. מיד לאחר האירוע נמלטו שלושת האחים לדירת המסתור בשטחי הרשות שם שהו עד ליום מעצרם.